Mengenalpasti skop serta rangka kerja penyelidikan dan pembanguanan (R&D) yang berpotensi bagi memenuhi aspirasi hidrografi negara.
Mewujudkan pangkalan data hidrografi selaras dengan keperluan Malaysia National Spatial Data infrastructure (NSDI) bagi memenuhi perkhidmatan perkongsian data hidrografi di Malaysia.
Mewujudkan mekanisme kerjasama yang efektif di kalangan ahli-ahli di mana projek, program dan aktiviti yang dirancang selari dengan rangka kerja hidrografi yang dibangunkan.
Mewujudkan mekanisme dialog yang efektif di kalangan ahli dalam menjalankan aktiviti-aktiviti hidrografi yang berkaitan untuk kepentingan bersama.
Membangunkan perkongsian pintar dalam pembangunan modal insan di kalangan ahli bagi mewujudkan kumpulan pakar bidang hidrografi di setiap agensi.

Jawatankuasa Hidrografi Negara (JHN) telah ditubuhkan pada tahun 1987 bagi mengkoordinasikan hal ehwal hidrografi dan aktiviti-aktiviti yang berkaitan. Secara amnya, jawatankuasa ini dianggotai oleh agensi-agensi kerajaan dan institut pengajian tinggi tempatan yang terlibat secara langsung dengan aktiviti yang melibatkan bidang hidrografi. Keanggotaan JHN ini melibatkan agensi dan institusi pengajian seperti berikut:

• Pusat Hidrografi Nasional.
• Bahagian Teknologi Strategik dan Aplikasi S&T, Kementerian Sains, Teknologi dan Inovasi (MOSTI).
• Pusat Geospatial Negara (PGN).
• Agensi Penguatkuasaan Maritim Malaysia (APMM).
• Jabatan Mineral dan Geosains Malaysia (JMG).
• Agensi Angkasa Malaysia (MySA).
• Jabatan Ukur dan Pemetaan Malaysia (JUPEM).
• Jabatan Laut Malaysia.
• Jabatan Laut Malaysia Wilayah Sabah.
• Jabatan Laut Malaysia Wilayah Sarawak.
• Jabatan Perikanan Malaysia.
• Bahagian Maritim, Kementerian Pengangkutan Malaysia.
• Institut Penyelidikan Hidraulik Kebangssan Malaysia (NAHRIM).
• Institut Sumber Marin Asia Tenggara
• Jabatan Pengairan dan Saliran Malaysia (JPS).
• Fakulti Geoinformasi dan Harta Tanah, Universiti Teknologi Malaysia (UTM).
• Fakulti Senibina, Perancangan dan Ukur, Universiti Teknologi Mara (UiTM).
• Pusat Kajian Samudera dan Pantai (CEMACS), Universiti Sains Malaysia (USM).
• Institut Oseanografi dan Sekitaran (INOS), Universiti Malaysia Terengganu (UMT).
• Malaysia Petrolium Management - PETRONAS.
• Geomatic Department - PETRONAS.
• Malaysia Shipowner's Association (MASA).

Secara umumnya, jawatankuasa ini memikul tanggungjawab yang besar sebagai pemangkin kepada pembangunan bidang hidrografi di Malaysia. Tanggungjawab ini merangkumi skop pembangunan teknologi hidrografi, pembangunan modal insan, keselamatan pelayaran, penerbitan produk nautika dan sebagainya. Peranan dan fungsi JHN adalah seperti berikut:

• Memantau dan mengkoordinasikan aktiviti-aktiviti yang berkaitan dengan bidang hidrografi di Malaysia.
• Menyelaras bagi mengelakkan pertindihan aktiviti hidrografi melalui kolaboratif strategik di kalangan agensi berkaitan hidrografi bagi tujuan perancangan dan pembangunan negara.
• Mengusulkan dasar, polisi dan peraturan bersesuaian mengikuti keperluan bidang tugas untuk kelulusan Jemaah Menteri.
• Mewakilkan PHN bagi kepentingan agensi-agensi kerajaan dalam forum dan mesyuarat berkaitan hidrografi di peringkat antarabangsa.
• Menubuhkan jawatankuasa-jawatankuasa kecil yang perlu bagi tujuan-tujuan yang ditetapkan.